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【原创】酵母双杂交 实验流程问题 请多指教 ! 实验方法
我上个月做了mating(酵母双杂交的一种办法)。
现在已经做到了,X-galassay。
从230多个克隆里第一次选出了68个蓝色克隆。
第二次挑选出了74个蓝色克隆。
可是,对比发现重复变蓝的只有11个。
WhatcanIdoforitNEXT~
我的具体步骤是。
一:文库建立
1.mammaliancelltotalRNA-->PolyARNA-->dsRNA-->提纯dsRNA。
2.将提纯的dsRNA转染到AH109细胞株,涂在150ㅠ待3~5天克隆出现并长势饱满.
3.每个150ㅠ,放入5mlfreezingmedia,将细胞收集在一起,均匀混合,1ml分装,-70度保存。
二:酵母双杂交
1.mating,matingproduct分别涂在40个TDO(SD/-H-L-T),10个QDO(SD/-A-H-L-T)。
2.matingefficiency3%大于下限值2%。
3.实验步骤说明上,说3-8天克隆会出现。可是我的大概12天才长了出来(TDO)。
小心的将TDO上长出来的280个克隆,转移到TDO。
再次培养了4天左右 发现 21个在转移后没有继续长,所以淘汰掉。
4.将TDO上的克隆,转移到 QDO (forstronginteractionassay)/ 牙签上 剩下的一点点细胞 划在了100ㅠ的TDO(forcolonyX-a-galfilterassay)。 双重选择,在QDO上生长,并在X-a-gal筛选中变蓝的克隆。
5.以上方法,选出223个在 QDO 上生长的克隆。
6.X-a-galfilterassay两次。
到这里 问题出来了 从230多个克隆里第一次选出了68个蓝色克隆。
第二次挑选出了74个蓝色克隆。
可是,对比发现重复变蓝的只有11个。
而且,书上说 X-a-galfilterassay最多不要超过8小时。
可是我的克隆,基本都是在6-8小时之间 变蓝的。
请大家 一起分析一下,怎么两次 X-a-galfilterassay 变蓝的差距这么大。
难道,都是假阳性??
我首先将两次实验重合的 11个克隆的 plasmidDNA提了出来,正在测序。
剩下的怎么办? 11个也太少了,之后的实验,怎么办? 有必要 再作一次 X-a-galfilterassay么?? 要是,又发生么变化,怎么办??
拜托各位!! !
编辑:wudihero007
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