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⑴测序是为了验证扩增产物是否为自己的目的产物,既然我的产物长度符合要求,那么有必要进行测序吗?②对于荧光定量检测,我先前的那对引物可以接着用吗?③如用ABI7700采用Taqman探针法检测,探针的设计是自行用软件(如primer5.0)或参考文献提交公司合成(像PCR引物合成)那样吗?④看到有的文章介绍,探针是国外的、国内的,这是什么意思?依我的理解:就像PCR引物合成,只要合成正确,荧光标记完好,国外国内不都一样吗?⑤看到有相应试剂盒提供,其提供的东西有哪几样?是不是探针,引物都包括了,对于那些常见的基因都有相应的试剂盒卖吧,关键是价钱贵吗?
看到一个同事做一课题就是设计荧光定量PCR检测某产物,结果半年也没搞出来,令我感到很生畏。现在还有很多临床病原微生物的荧光定量检测还未成功,有的还需优化,是不是设计较困难,哎呀,还未做,就感到力不从心了,大家帮帮我
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回复:时间:2005-11-10
我接触的时间也不长,可以交流一下经验。(2)对于荧光定量检测,先前设计的引物应该可以适用。如果采用SYBR Green法,没太大问题,但用TaqMan探针法的话,就要对引物及探针进行评估。(3)如果找公司合成探针的话,就可以让公司给设计,只要提供模板即可,反正又不收费,而且人家有经验。当然自己设计也可以了。(4)确实像你说的,国外和国内合成都可以,只是现在有些大公司的跟踪服务好一些,会减少摸索试验条件的时间等。以我们这的试验结果来看,国内的探针设计的也都还不错。(5)试剂盒里只有酶等反应体系,不包括探针和引物,这些都是需要根据你的模板具体进行设计的。而试剂盒是通用的,比如SYBR Green试剂盒啊,里面就包括酶、SYBR Green染料等,按照说明加入模板和引物就可以了;探针类的试剂盒包括酶等,加入模板、引物和探针可以进行反应。价格还可以,以一般最小包装来计,国内的1500左右,国外的2000或以上吧。其实只有把试验理顺了,荧光定联PCR没有那么可怕,祝你成功!
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回复:时间:2005-11-08
偶来答答~~1.片段大小一致应该是跑Marker得出的结论吧?这个只能是个大致值,并不能肯定和你所需要的片段完全一致,就算一致,也有可能运气不好是非特异扩增。测序是确定片段是否是你所需的唯一、最终的金标准。2、3.如果以前那对引物扩增片段在250以内的话,可以用sybrgreen法做荧光定量。如果taqman探针法的话,就要重新设计。taqman探针可以用ABI公司的primerexpress设计(并非primer5),然后给公司合成。当然参考国外文献上的引物探针也未尝不可,只是有些文献如果设计到知识产权的话,作者可能会更改引物序列。4.国内国外引物探针应该差不多。但现在很多国内的什么什么公司其实就是国外公司的代理~~5.偶没用过试剂盒。不过有些专门针对某些病原微生物的,其中是有相应的引物探针的,如乙肝定量检测试剂盒。sybrgreen的试剂盒如huixu所说,可能有的有rox试剂。其它的就由其它战友补充了~~6.病原微生物的定量检测研究的确很多,难度也大些。主要是个检测方法的特异性和灵敏度的问题。因为病原微生物变异大,而定量方法比较灵敏,尤其taqman探针序列上的变异就可能导致检测结果的遗漏,所以都还需要不断摸索~~
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