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1.怎么看两个反应-即目标基因和内参基因是否具有相同的扩增效率?
2.每次PCR反应的扩增情况都有差异,多次反应的扩增效率岂不是都不一样了吗?
3.如何设计才能让相对定量更可行?
由于对定量PCR的接触不多,希望各位高手多多帮助!谢谢!
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回复:时间:2021-08-23
小妹还有几个问题想请教:1、同一台荧光定量pcr仪是否即可以作探针也可以作染料的。2、探针和染料的试剂盒是否一样的。3、我要用的是探针,可不可以推荐一些价格便宜一点的试剂盒。4、我要扩增的片断是160bp,这种长度能否通过合成制定标准品。5、请问哪里可以找到如何使用纯化样品的PCR产物作标准品的方法的相关资料。
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回复:时间:2021-08-31
看了这么多,此话题的前面的内容挺不错,后面的大家的问题我大概总结一下,1.关于绝对定量,相对定量的问题绝对定量:从字面理解,目的是要知道你的基因的具体拷贝数。相对定量:要知道你的基因的相对表达量。见NucleicAcidsResearch,2001,Vol.29,No.900,文章题目:anewmathematicalmodelforrelativequantificationinreal-timert-pcr.TAKARA,有篇“COMPETITIVEPCRGUIDE”讲内参照的,可以看看。2.试剂溶解的问题,一般用去离子灭菌水即可,宝贵的样品可以按照各位主任说的没错。如果是新手本版内容从头仔细看看。3.反应体系:1)MG2+浓度肯定和普通的不一样,3.5-8不等,有文献有过详细的分析,文章我没找到,去网上找一下,用英文关键词。2)引物的浓度和探针浓度比例非常重要,仔细摸索一下,肯定可以解决,2:1~9:1不等,3)据我的实验看,体系的体积好像对实验也有影响,具体不明,4)实验具体的浓度量没个定量的,每个基因的效果也不一样,我一年前的探针,(探针没有稀释)怎么都做不好,现在拿出来做,结果很好,什么MG2+,引物,探针啊,我没有计算他们的量,随手加的。4.反应条件:正如痛并快乐着丁香园主任所说,两步法即可,如果你三步法结果可以也无妨。5.Taqman,sb区别,看一下他们的工作原理,网上很多文章,sb可以除了定量,还可以做溶解度曲线,可以看出是否有非特异扩增。www.wzw.tum.de/gene-quantification/此网站有很多关于定量PCR的文献,认真看,很好的。
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