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大家好,本人是实验新手一枚,目前在学做琼脂糖电泳,我是提取基因组DNA,然后以500ngDNA为模板,按照以下反应体系PCR:Q5高保真热启动2Xmastermix12.5UL;上下游引物终浓度0.5uM,DNA模板500ng,加水补支总体积25ul,反应程序,98℃30s,98℃5S,62℃10s,72℃20s,35或者40个循环,72℃2min,4℃保存,PCR产物取5UL行2%琼脂糖电泳,EB染色,50ul琼脂糖胶加入10mg/mlEB染液5ul,但是结果几乎看不到条带,但是Marker很清晰。最后我把PCR产物用分光光度计测量浓度,发现浓度在400-600ng/ul之间,260/280接近1.80,我想知道我哪里做错了,才导致看不到条带呢?请园子里的老师指教,在此,我首先感谢大家了!
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回复:时间:2017-06-01
What kind of genomic DNA is? Do you have any gel picture showing genomic DNA? What the gene is to be amplified. I am not sure if 98 C, 30 S is good for Taq DNA polymerase activity.
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回复:时间:2017-05-26
展开引用mparkWhatkindofgenomicDNAis?DoyouhaveanygelpictureshowinggenomicDNA?Whatthegeneistobeamplified.Iamnotsureif98C,30SisgoodforTaqDNApolymeraseactivity.......老师您好,我用的是培养的细胞系,经慢病毒感染后提取的DNA,用的是TARAKA的全基因组DNA提取试剂盒。扩增的基因是CXCR4因,PCR用的酶是NEB公司的Q5HotStartHigh-Fidelity2XMasterMiX,扩增程序是NEB试剂盒推荐的,98℃30s也是试剂盒所给出的时间。
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回复:时间:2017-05-27
展开引用mparkWhatkindofgenomicDNAis?DoyouhaveanygelpictureshowinggenomicDNA?Whatthegeneistobeamplified.Iamnotsureif98C,30SisgoodforTaqDNApolymeraseactivity.......这个有条带的是第一次的实验结果,只是第一次之后就再也没有条带出来了!
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回复:时间:2017-05-22
mparkIcouldnotseeanygenomicDNA.FromhowmanycellsisgenomicDNAisolated?大于1x10的6次方,而且我提出来的DNA测浓度的话也都在100ng/ul以上呀
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回复:时间:2017-05-26
TrytomakefreshgenomicDNAandrun2-3ugofthesampleonthegeltoverifygenomicDNAbeforerunninganyPCRreaction.
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回复:时间:2017-05-31
mparkTrytomakefreshgenomicDNAandrun2-3ugofthesampleonthegeltoverifygenomicDNAbeforerunninganyPCRreaction.老师,您的建议我稍后会试试看。今天我用了PCR产物中的15ul(总共25ul)来跑电泳,终于看见条带了,但是这样算起来的话上样总量就有6ug了。因为我的目的片段只有500多碱基对,跟这个有关系吗?
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回复:时间:2017-06-01
展开引用米扬my大家好,本人是实验新手一枚,目前在学做琼脂糖电泳,我是提取基因组DNA,然后以500ngDNA为模板,按照以下反应体系PCR:Q5高保真热启动2Xmastermix12.5UL;上下游引物终浓度0.5uM,DNA模板500ng,加水补支总体积25ul,反应程序,98℃30s,98℃5S,62℃10s,72℃20s,35或者40个循环,72℃2min,4℃保存,PCR产物取5UL行2%琼脂糖电泳,EB染色,50ul琼脂糖胶加入10mg/mlEB染液5ul,但是结果几乎看不到条带,但是Marker很清晰。最后我把PCR产物用分光光度计测量浓度,发现浓度在400-600ng/ul之间,260/280接近1.80,我想知道我哪里做错了,才导致看不到条带呢?请园子里的老师指教,在此,我首先感谢大家了!......谢谢大家的讨论的指导,最后我找了我们隔壁实验室的同学做技术指导,换了一种酶,然后跑出来了!接下来我准备采用他这次的体系和扩增酶来进行接下来的实验,希望自己实验顺利。后续实验情况会陆续更新,当然也欢迎大家指导和讨论!
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