RNA提取纯化试剂

...生物素化寡聚脱氧胸苷链亲和素磁珠纯化带 Poly(A)+RNA 实验方...

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试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一材料与设备

1)亲和素-磁珠(SA-PMP)

2)GTC抽提缓冲液:4moL/I,异硫氰酸胍,25mmol/L柠檬酸钠,pH:7.1

3)生物素标记的oligo(dT)探针(50pmol/ul)

4)稀释缓冲液:6XSSC,lmmol/LTris-HCl,PH7.4,lOmmoL/LEDTA,0.25%SDS

5)β-巯基乙醇(48.7%)

6)无RNase水

7)20XSSC:67.7gNaCl和44.lg柠檬酸钠溶于400ml去离子水中,用NaOH调pH至7.2,加水至500ml体积,用0.1%DEPC处理过夜,高压灭菌

8)0.5XSSC: 20XSSC用无RNase水稀释而成

9)1XPBS

10)磁架

11)75℃水浴

12)50ml无菌Corex离心管

13)15ml螺旋盖锥形离心管

14)TissuemizerDM或其他同类匀浆器

15)BeckmanJ2-21离心机或其他类似设备


二操作方法

以重量小于0.125的组织中mRNA的纯化为例,大量组织和细胞中mRNA的纯化可参阅相关产品说明书。

1)从冰箱中取出GTC抽提液、生物素标记的oligo(dT)探针、无RNA酶的水及0.5XSSC,平衡至室温并预热稀释液至70℃

2)在50ml无菌螺旋盖锥形离心管屮,首先加入lml抽提液(抽提/BME缓冲液)然后再向其中加人41ulβ-巯基乙醇(48.7%),保证β-巯基乙醇的终浓度为2%。井将装有缓冲液的管子称重并记录。

3)尽可能快地取得所需量的组织并放人到装有抽提/BME缓冲液的管中,使用小匀浆器髙速匀浆组织至无可见组织块。如果无匀浆器,则可将组织快速切碎,液氮冷冻,在装有液氮的研钵中捣碎研磨。将液氮和组织转移到无菌的50ml螺旋盖锥形管中,液氮挥发后,立即加人抽提/BME缓冲液,使之完全混合

4)将含有组织及抽提/BME缓冲液的骨子称重,减去第2)步中的管重并计算组织块的大小。

5)参考图2.1,根椐第4)步计算的组织块大小决定生物素标记的oligo(dT)探针用量和亲和素-磁珠(SA-PMP)用量。

6)将2ml预热稀释缓冲液加到无菌管中,加入41ulβ-巯基乙醇(48.7%),终浓度为1%。将此溶液加至匀浆液中.完全混合。再加入第5步确定的探针,晃动以充分混合,并在70°C温育5min

7)转移匀浆液至一清洁无菌的15mlCorex管屮,室温12000g离心1Omim

8)离心时,轻轻晃动使SA-PMP完仝悬浮,将所需量的磁珠转移到一无菌的50ml螺旋盖锥形管中,将此管放置在磁架上。水平放置磁架至磁珠全部聚集在管的一侧。倾斜管子使溶液不流经磁珠表面.小心倒掉储存液

9)用等体积的0.5XSSC悬SA-PMP,用磁架捕捉,按第8步倒掉SSC溶液。重复洗涤两次后,将SA-PMP重悬在初始体积0.5XSSC中。
10)勻浆液离心完成后,小心取出上清,避免吸取沉淀。将已澄清的匀浆液加人含洗涤好的SAPMP的管中,翻转混合

11)将匀浆液及SA-PMP室温孵育用磁架捕捉SAPMP至勻浆液淸澈.按前述方法小心倾去上清液。用一无菌管收集上清液,放在冰上保存直至能肯定mRNA已获得令人满意的结合和洗脱

12)于lml0.5XSSC中宙悬磁珠,再转移到2ml试管中.用磁架捕获磁珠,小心倾去SSC,重复洗涤两遍。最后一次洗后要尽可能多地去除SSC而不搅动SA-PMP。

13)用0.5mL无核酶的水洗脱mRNA,轻振试管重悬SA〜PMP。

14)用磁架捕捉SA-PMP,将洗脱的RNA转移到无蔺小离心管中。用无菌水重悬磁珠,保存在冰中直至mRNA产量和纯度被确定。

15)向洗脱液中加入0.1倍体积的NaAc(用于CDNA克隆)或KAc(用于体外翻译)和1倍体积的异丙醇,放置过夜。

16)于12000g离心lOmin,用lml70?%乙醇重悬RNA沉淀T再离心

17)真空干燥沉淀15min用无RNase的去离子水溶解沉淀。


                           
注意事项
1)β-巯基乙醇具冇较大毒性,应在通风橱中配制并配戴合适的防护设备。

2)洗脱液中可能有残存磁珠,于12OOOg离心lmin,上清转移至一新管中.不过,残存的磁珠不会抑制RNA使用中所用的大多数常规酶反应并且它们常常有助于沉淀后的沉淀物定位。