2021-08-09siRNA和shRNA区别

楼主想多了，其实shRNA就是根据siRNA来设计的。比如说你先设计了几对siRNA，经过转染后检测目的基因表达情况，可以筛选一条沉默效果最好的siRNA，但siRNA是化学合成的只能瞬转，用完了还得买，如果想做长期研究的话就可以构建shRNA载体了， 用siRNA的序列加段loop来设计出shRNA，再连上质粒或病毒载体就可以了。具体还可以参考以前园子里面的帖子：【原创】miRNA,siRNA,dsRNA与shRNA的区别 【求助】shRNA和siRNA的区别【求助】shRNA和siRNA有啥区别？ 【求助】shRNA与 siRNA的区别 【求助】请教关于shRNA和siRNA选择

好的，谢谢你

mark

简单点说，稳转用shRNA病毒，瞬时实验用siRNA。如果你构建shRNA质粒做瞬转，就有点画蛇添足了，siRNA合成现在很便宜，300多一条，构建一个质粒成本远远高于这个，还有干扰一般做一个没有保障，多做几个费用更高，现在的siRNA专用转染试剂可以把siRNA高效转染细胞的，包括大部分原代细胞，比如Life的RNAimax，Transheep的Namipo，都可以的，而且毒性低，可以反向转染，多加几次也能延长左右时间。如果你要构建细胞系，那必须用shRNA慢病毒，human和mus的一般公司都有现货的克隆的，比自己构建省事省钱，sigma和Transheep都有这样的文库，几乎所有的基因都能查到的，一个基因可以提供几个克隆的，干嘛自己辛苦去构建，拿回来自己包装病毒就行，下面是我转染的siRNA-CY5到原代神经元，用的Namipo