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【精彩回放】王辰院士:病原分子诊断走向临床的进展与挑战

mayitao /发布时间:1628271002 /浏览量:54

提供商：	illumina
服务名称：	数字化基因表达谱测序（DGE）服务

数字化基因表达谱（DigitalGeneExpressionProfiling，DGE）利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术，能够全面、经济、快速地定量检测某一物种特定组织或发育时期的基因表达种类和丰度信息，具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点，可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等多个领域。华泰亿康可根据客户需求，灵活选择合适的测序深度，以达到对不同丰度转录本的检测要求。

技术优势
1、数字化信号：测序直接获得每个基因的特异表达标签序列，无背景噪音，无交叉杂交；可鉴别序列间单个碱基的差异；通过计数表达标签序列的数目来确定该基因的表达量，大大提高了定量分析的准确度；
2、高通量：一次测序得到1000万条以上的序列；
3、检测阈值宽：跨越6个数量级的宽检测阈值，从几个到数十万个拷贝精确计数；
4、良好的重复性：深度测序保证了抽样随机性，不同批次的表达谱度量准确，无需重复实验，能够更准确的进行差异表达分析；
5、定量更准确：使用RPKM方法计算基因表达水平。

样品要求
样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA；
样品需求量（一次建库量）：人、小鼠、大鼠样品：≥2μg，其他类型样品：≥2μg；
样品浓度：人、小鼠、大鼠样品：≥80ng/μl，其他类型样品：≥200ng/μl；
样品纯度：动物样本：RIN≥7.0，28S:18S≥1.0，植物样本：RIN≥6.5，OD260/280≥1.8，OD260/230≥1.8，28S:18S≥1.0，昆虫样本无此要求。

参考文献
[1]YuL,ChenX,WangZ,etal.ArabidopsisEnhancedDroughtTolerance1/HOMEODOMAINGLABROUS11ConfersDroughtToleranceinTransgenicRicewithoutYieldPenalty[J].PlantPhysiology,2013,162(3):1378-1391.
[2]QiXH,XuXW,LinXJ,etal.Identificationofdifferentiallyexpressedgenesincucumber(CucumissativusL.)rootunderwaterloggingstressbydigitalgeneexpressionprofile[J].Genomics,2012,99(3):160-168.
[3]HideoMatsumura,etal.High-throughputsuperSAGEfordigitalgeneexpressionanalysisofmultiplesamplesusingnextgenerationsequencing.PLoSONE.2010,August.Vol.5:e12010.

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